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E' possibile ordinare i sommari dei messaggi in una finestra di casella a seconda del loro stato, della loro priorità, del mittente, della data o dell'argomento. Questi comandi sono elencati nel sottomenu Sort sotto il menu Edit.

Per usare questi comandi, per prima cosa si deve aprire la casella che deve essere ordinata. Quindi, selezionare il comando appropriato dal sottomenu Sort. I messaggi della casella vengono ordinati quando il bottone del mouse viene rilasciato.
Eudora ordina in ordine crescente,;con il valore più piccolo per primo. Per ordinare in modo decrescente, premere il tasto [option] mentre si sceglie il comando desiderato dal sottomenu Sort.
suggerimento: l'algoritmo di ordinamento di Eudora è "stabile." Questo significa che smistando una particolare colonna lascia i messaggi dello stesso valore nello stesso ordine che avevano prima. Questa caratteristica permette di ordinare la posta basandosi su diversi criteri ed utilizzando comandi di ordinamento multipli. Ad esempio se si desidera smistare i comandi in base al soggetto e per ogni soggetto si vogliono ordinare i messaggi in base alla data, selezionare prima Sort by Date, e poi Sort by Subject.
Nota: A volte Eudora non effettua l'ordinamento in base alla data in modo corretto. Questo succede se la posta è stata registrata in una precedente versione di Eudora e l'indice dei contenuti è stato ricostruito o se i messaggi hanno formattato in modo errato i campi per la data.